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初見葉文秀,他一身西裝,整齊潔白的襯衫領(lǐng)上方,是一張笑盈盈的年輕臉龐。 他很健談,即使是研究過程中棘手的問題,也會風趣幽默地講述。 人長得溫文爾雅,名字也溫柔秀氣。但葉文秀骨子里“十分要強”,并不是隨意妥協(xié)的人。也許正因為這樣的性格,才能讓他在與一群植物學(xué)家和生物信息學(xué)家的“戰(zhàn)場”上,“平定戰(zhàn)火,冷靜指揮”。 近日,濰坊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)山東省實驗室、北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院研究員葉文秀和郭立團隊聯(lián)手,在國際科技期刊《自然-遺傳學(xué)》(Nature Genetics)發(fā)表研究成果,成功繪制出涵蓋葡萄屬三大地理種群的單倍型超級泛基因組圖譜。這是中國在葡萄研究領(lǐng)域里取得的里程碑式重大突破。 葉文秀曾在日本留學(xué)8年。他說:“在日本的留學(xué)以及科研工作經(jīng)歷對自己人生的影響非常大。”FfT即熱新聞——關(guān)注每天科技社會生活新變化gihot.com
葉文秀
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他本科就讀于大連工業(yè)大學(xué)食品學(xué)院,在朱蓓薇 院士團隊中做研究助理,研究海珍品精深加工。 在朱蓓薇院士團隊學(xué)習(xí)期間,葉文秀多次與日本岡山大學(xué)教授村田芳行交流,學(xué)習(xí)其有關(guān)植物生理方面的課程。他了解到當植物感受到外界刺激(如受傷或光照變化)時,細胞膜上的離子通道會打開或關(guān)閉,帶電粒子進出細胞,產(chǎn)生電信號。 植物雖然沒有神經(jīng)系統(tǒng),卻通過類似“信息傳遞員”的電信號傳遞信息。這讓葉文秀產(chǎn)生濃厚興趣,覺得會是一個很有意思的方向。 本科畢業(yè)時,相比繼續(xù)鉆研加工領(lǐng)域,葉文秀更傾向于做有關(guān)植物生理方面的基礎(chǔ)研究。 朱蓓薇院士早年曾留學(xué)日本,非常支持有想法的年輕人,并積極為葉文秀推薦導(dǎo)師。于是,葉文秀拜入村田芳行門下,開啟研究生階段。 在日本時,憑借著不錯的英語水平,葉文秀無論是閱讀專業(yè)的英文文獻還是與科學(xué)家們交流,都比較順暢。 然而,導(dǎo)師給他下了一道死命令:畢業(yè)答辯必須用日語,自己看著辦! 能怎么辦?葉文秀明白:想融入本土文化,得先過語言關(guān)。既然有需求,就只能學(xué)了。 村田教授很有個性,他給自己的學(xué)生開了一個晨間seminar。每天早上七點鐘,教學(xué)生學(xué)英語。英語還不錯的葉文秀期期不落。 對日本人來說,是學(xué)習(xí)如何將日語翻譯成英語。對葉文秀來說,同時學(xué)習(xí)兩門語言,一箭雙雕。雖苦,但何樂而不為呢? 這個晨間seminar,他一直堅持參加,直到博士畢業(yè)。 從2011年來到岡山大學(xué),他就開始接受系統(tǒng)的科研訓(xùn)練。第二年,葉文秀就有幾篇作為參與作者發(fā)表的文章。第三年,他在權(quán)威期刊上發(fā)表了自己作為第一作者的文章,隨后跟著導(dǎo)師滿世界進行學(xué)術(shù)交流。2013年,他繼續(xù)留在村田實驗室攻讀博士學(xué)位,不久獲得了日本學(xué)術(shù)振興會特別研究員的榮譽。 有了前期的研究基礎(chǔ),只用了兩年半時間,他就取得了博士學(xué)位,是岡山大學(xué)為數(shù)不多提前畢業(yè)的博士生。 2016年,他申請到了英國塞恩斯伯里實驗室的博士后。 在英國短暫待了一年后,因家庭和課題方向的原因,他再次回到日本,在名古屋大學(xué)做博士后。他還在2017年成為了日本學(xué)術(shù)振興會外籍特別研究員。 在外留學(xué)8年后,2019年,葉文秀做了一個重要的決定——帶著自己的研究積累回國。 200%精力FfT即熱新聞——關(guān)注每天科技社會生活新變化gihot.com
葡萄在農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)中地位特殊,僅葡萄酒的市場規(guī)模其他水果就無法相比。作為重要經(jīng)濟作物,葡萄在全球范圍內(nèi)都非常“受寵”。 在此前對植物氣孔的研究中,葡萄一直是葉文秀的研究對象之一。回國后,他對葡萄領(lǐng)域的研究越發(fā)感興趣。FfT即熱新聞——關(guān)注每天科技社會生活新變化gihot.com
葉文秀在葡萄園采樣 ?FfT即熱新聞——關(guān)注每天科技社會生活新變化gihot.com
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幸運的是,2022年,他收到了美國國家 科學(xué)院院士、北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院 院長鄧興旺拋來的橄欖枝,邀他加入研究院,并牽頭成立濰坊市葡萄種質(zhì)創(chuàng)新與利用重點實驗室。 研究之初,基因組學(xué)的發(fā)展到了泛基因組的重要轉(zhuǎn)變關(guān)口。 因此,從研發(fā)之初,整個實驗室就將其定性為一項攻關(guān)工作。 “我們用200%的精力,投入實驗室所有資源搶時間。”葉文秀介紹道。 他們要做的,是將葡萄的三大地理類群——歐亞種群、北美種群和東亞種群的泛基因組構(gòu)建完成。這是了解葡萄遺傳多樣性、開展功能基因組學(xué)研究、識別隱性遺傳特性以及葡萄精準改良的關(guān)鍵資源。 葉文秀將其比喻為“一群植物學(xué)家和一幫生物信息學(xué)家的故事。生物信息學(xué)家是心臟,提供血液;植物學(xué)家是大腦,提供方向。” 想要研究葡萄的霜霉病,得先研究明白葡萄的氣孔。氣孔是懂“養(yǎng)生”的,它會有節(jié)律地運動,早上會醒來、晚上會睡覺,冬夏不一樣,晴天陰天也不一樣。 因此,為了能采集完整樣本,團隊多次到中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所采樣。因為這里有珍貴的葡萄種質(zhì)資源。 為了完成時間梯度實驗,團隊進行了精密的實驗設(shè)計,三班倒、無間斷觀察。 盛夏頂著大太陽觀察葉片、半夜頂著困意收集樣本的滋味,并不好受。 下半場,從戶外轉(zhuǎn)戰(zhàn)滿是儀器和計算機的室內(nèi)。主角是郭立研究員負責的數(shù)據(jù)分析團隊。 在如何分析組建出來的單倍型基因組的功能與作用問題上,團隊內(nèi)部曾發(fā)生不少分歧。 比如,在構(gòu)建單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹的時候,發(fā)現(xiàn)多個葡萄樣本的種群歸屬的結(jié)果與二倍體系統(tǒng)發(fā)育進化樹的結(jié)果不一致。哪種更合理? 植物學(xué)家們認為是分析技術(shù)上的問題,技術(shù)還需要改進;生物信息學(xué)家們則認為需要從葡萄雜交史解釋。 于是,葡萄“江湖”的兩派人馬坐在一個房間里,激烈地“切磋”著,卻一直無法達成一致。每個人都神情專注,堅守自己的“陣地”。最后,這場“唇槍舌劍”由團隊負責人葉文秀和郭立“華山論劍”、拍板決定,兩君子握手言和。
濰坊葡萄種質(zhì)創(chuàng)新與利用重點實驗室團建 ?FfT即熱新聞——關(guān)注每天科技社會生活新變化gihot.com
沖刺FfT即熱新聞——關(guān)注每天科技社會生活新變化gihot.com
即使投入200%的精力,不舍晝夜和時間賽跑了一年多后,他們還是落后了一步。 2023年初,在采集數(shù)據(jù)的過程中,他們得知一個美國的團隊已將關(guān)于北美葡萄的相關(guān)文章發(fā)了出來。這意味著,即使他們的研究完成了,也沒有絕對的創(chuàng)新性效果。要知道,想要沖擊正刊,即使是對創(chuàng)新度的一丁點損害也是致命打擊。 他們果斷做出決定——拿現(xiàn)有的成果投稿! 在投稿過程中,他們還面臨骨干成員的流失問題,時常處于焦急甚至焦慮的狀態(tài)。就像是長跑結(jié)束前的最后百米沖刺階段,即使用盡全身力氣,步子仍然沉重。 為了讓文章盡快正式刊登,團隊曾考慮降低對發(fā)表期刊水平的要求。 這時候,鄧興旺院士給了他們強有力的支撐——“你們的工作質(zhì)量很高,會對該領(lǐng)域產(chǎn)生重大影響,在頂級期刊刊登有助于成果的推廣”。 他們決定,即使難以在正刊發(fā)表,工作也要繼續(xù)。 2024年下半年,Nature Genetics的編輯表示對他們的研究很感興趣,文章最終被接收! 這份單倍型超級泛基因組圖譜,揭示了葡萄屬豐富遺傳多樣性和雜交歷史,促進了葡萄精準分子育種研究,開啟了葡萄種質(zhì)創(chuàng)新和利用新時代。 葉文秀坦言道:“服務(wù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展并不是簡單的提供服務(wù),更多的是從底盤改進。解決葡萄產(chǎn)業(yè)最嚴重的霜霉病問題,離不開對其機理的研究工作。” 從海珍品加工到葡萄機理研究,倏忽15年過去。回想當初自己究竟為什么會這樣選擇,葉文秀認為一是因為感興趣,二是為了產(chǎn)業(yè)發(fā)展做些工作。 在日本留學(xué)的8年間,導(dǎo)師雖然嚴格,但是給了學(xué)生足夠的自由。他們不看重結(jié)果,而是著重于培養(yǎng)學(xué)生的批判性和邏輯性思維能力。這也是葉文秀為自己的學(xué)生始終指引的方向。 文章發(fā)表后,他自己知道,對葡萄的研究,只是開始。 如果能通過現(xiàn)有的基礎(chǔ)研究,既解決葡萄抗病問題,又能釀出中國人愛喝的葡萄酒,將是實實在在地將論文寫在大地上。 “讓葡萄酒產(chǎn)業(yè)健康發(fā)展;讓老百姓多喝一點葡萄酒,享受美好生活。”當被問到有什么更長遠的想法時,葉文秀笑著回答道。
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